- 2020년 ~ 현재
- 2010년 ~ 2019년
- 2000년 ~ 2009년
- 1992년 ~ 1999년
- 2025. 05. 01
- 제 19대 원장 김학진 교수 취임.
- 2025. 03. 07
- 재활용환경성평가기관 지정(국립환경과학원)
- 2025. 01. 22
- 환경위해성·자원순환센터 명칭 변경
- 2023. 05. 01
- 제 18대 원장 강문성 교수 취임
- 2022. 11. 25
- NICEM 설립 30주년 기념식
- 2022. 03. 21
- 표준개발협력기관(COSD) 및 ISO/TC 190(토양의 질) 간사기관 지정(국립환경과학원)
- 2021. 09. 17
- "LC-MS/MS를 이용한 토양 중 화햑관련 성분 정량방법" ISO 11916-3 국제 표준 승인 및 발간
- 2021. 05. 01
- 제 17대 원장 현진호 교수 취임
- 2020. 02. 19
- 청소년수련활동 인증기관 지정
- 2019. 05. 01
- 제 16대 원장 이창규 교수 취임
- 2018. 09. 21
- "IC를 이용한 토양 중 퍼클로레이트 분석방법" ISO 20295 국제 표준 승인 및 발간(세계 최초)
- 2018. 07. 01
- 제 15대 원장 임정빈 교수 취임
- 2016. 07. 01
- 제 14대 원장 임정빈 교수 취임
- 2016. 06. 24
- 국가공인시험기관(KOLAS) 숙련도시험운영기관 지정
- 2014. 11. 18
- 국가공인시험기관(KOLAS) 표준물질생산기관 지정
- 2014. 07. 01
- 제 13대 원장 김관수 교수 취임
- 2013. 08. 27
- "HPLC를 이용한 토양 중 화약류 분석방법" ISO 11916-1 국제 표준 승인 및 발간
- 2013. 08. 23
- 토양관련전문기관 위해성 평가 기관
- 2012. 11. 26
- 서울대학교 부속기관 평가 (대형 부속기관 발전도 1위)
- 2012. 11. 22
- NICEM 설립 20주년 기념식
- 2012. 07. 01
- 제 12대 원장 김관수 교수 취임
- 2012. 03. 26
- 토양관련전문기관(토양환경평가) 지정
- 2011. 08. 08
- 제11대 원장 최인규 교수 취임
- 2011. 05. 30
- 농산물안전성검사기관 지정(국립농산물품질관리원)
- 2011. 03. 10
- 국제공인시험기관(KOLAS) 법과학시험/DNA형검사 분야 3개 항목 추가 인증 획득
- 2010. 07. 01
- 나노바이오이미징센터, 환경표준물질센터 설립
- 2009. 11. 20
- 서울대 부속기관 평가 최우수기관 선정
- 2009. 08. 08
- 제10대 원장 최인규 교수 취임
- 2008. 11. 05
- 국제공인시험기관(KOLAS) 인증 획득
- 2008. 07. 08
- 먹는물 수질검사기관 지정
- 2008. 05. 16
- 지하수영향조사기관 지정
- 2007. 11. 01
- 서울대 부속기관 평가 최우수기관 선정
- 2007. 11. 01
- 농생명과학공동기기원으로 기관명칭 및 6개 센터, 13개 기기실로 조직 확대 개편
- 2007. 08. 08
- 제9대 소장 이석하 교수 취임
- 2006. 01. 04
- 생명ㆍ환경과학 교육사업단 설립
- 2005. 08. 08
- 제8대 소장 이석하 교수 취임
- 2004. 03. 08
- 서울대학교 관악캠퍼스로 이전
- 2003. 08. 08
- 제7대 소장 이변우 교수 취임
- 2002. 12. 14
- 제6대 소장 박은우 교수 취임
- 2002. 11. 22
- 농업과학공동기기센터 설립 10주년 기념 심포지엄 개최
- 2002. 09. 19
- 환경부 측정분석 토양분야 정도관리 최우수기관 선정
- 2000. 12. 14
- 제5대 소장 박은우 교수 취임
- 2000. 11. 22
- 토양오염분석사업단 설립
- 2000. 08. 07
- 한-아세안환경협력사업단 설립
- 2000. 04. 11
- 공초점현미경연수센터 설립
- 1999. 11. 23
- 제 11차 IBRD 교육차관 US $630,000 배정
- 1998. 12. 14
- 제4대 소장 박은우 교수 취임
- 1998. 11. 24
- 환경부 토양관련전문기관 (토양오염조사) 으로 지정
- 1998. 07. 24
- 제 10차 IBRD 차관 US $ 900,000 추가 배정
- 1998. 01. 01
- 교육부의 전국단위 공동기기센터로 승격
- 1997. 11. 27
- 병역법 제 74조 규정에 의거 병역특례기관으로 선정
- 1996. 12. 14
- 제3대 소장 박은우 교수 취임
- 1996. 03. 01
- 서울대 농생대 부속 법정 연구지원기관으로 승격 - 서울대 설치령 개정령(대통령령 제 14923호)
- 1995. 03. 25
- 서울대 농생대 전자현미경실 및 중앙분석실 센터에 통합
- 1994. 12. 14
- 제2대 소장 이돈구 교수 취임
- 1993. 06. 30
- 정부와 세계은행 간의 제 10차 IBRD 환경연구 교육차관사업
- 1992. 12. 14
- 초대 소장 한인규 교수 취임
- 1992. 11. 25
- 서울대 농생대 부설 농업과학공동기기센터 설립
