1층
- 101
- 대강의실
- 102
- 페놈분석기기실
- 103
- 시설관리실
2층
- 201
- 잔류성유기오염물질분석실
- 203
- X-선구조분석기기실
- 204
- 광학현미경실
- 205
- 나노바이오이미징센터
- 206
- 실내환경분석센터
- 207
- 재료물성분석기기실
- 208-2
- 이물&미세플라스틱분석실
- 208-1
- 주사전자현미경실
- 209
- 주사전자현미경실
- 210
- 주사전자현미경실
- 211
- 투과전자현미경실
3층
- 301
- 표준시료보관실
- 302
- 농산물전치리실 I
- 302
- 먹는물전처리실 I
- 304
- 안정성동위원소분석실
- 305
- 토양오염분석센터
- 305
- 먹는물분석센터
- 306
- 행정실
- 307
- 원장실
- 308
- 안내실
- 309
- 토양·수질전처리실 I
4층
- 401
- 환경위해성·자원순환센터
- 402
- 토양·수질전처리실 II
- 402
- 농산물전처리실 II
- 403
- 센터운영부
- 405
- 일반 분석실 Physico-chemical Analysis Lab
- 406
- 토양오염분석센터 / 먹는물분석센터
- 407
- 환경표준물질센터
- 408
- 토양지하수조사1팀
- 409
- 생물공학기기실 III
- 410
- 생물공학기기실 II
- 411
- 생물공학기기실 I
- 411
- 유전체분석센터